Question d'origine :
Quel rôle joue la polymerase IV durant le développement précoce (entre le 2eme et le 5eme jour post-germination) chez la plante Arabidopsis thaliana ...?
la réponse doit être au rayon génétique je crois...
Merci !!!!!!
Réponse du Guichet
gds_db
- Département : Equipe du Guichet du Savoir
Le 31/03/2006 à 13h28
Arabidopsis thaliana est une plante de la famille des Brassicacées (Crucifères) à laquelle appartiennent de nombreuses espèces cultivées utilisées dans l'alimentation (chou, navet, radis, raifort, moutarde etc.). C'est une plante herbacée de 10 à 15 cm de haut à l'état adulte. Elle est formée d'une rosette de feuilles de 2 à 5 cm de diamètre située au ras du sol dont se détachent une courte racine et un pédoncule floral portant une inflorescence. D'autres inflorescences se forment sur les rameaux secondaires. Les fleurs blanches de quelques mm sont typiques des Crucifères avec quatre sépales et quatre pétales disposés en croix, quatre étamines et un pistil. Il y a autofécondation et chaque fleur se transforme en un fruit qui est une capsule allongée, une silique, contenant de 30 à 50 minuscules graines. Chaque plant peut ainsi produire plusieurs milliers de graines à chaque génération. Si la lumière, la température et les autres facteurs de croissance ne sont pas limitants, le cycle se déroule en six à huit semaines.
source : www.snv.jussieu.fr
On trouvera dans MT Washington et al.; Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 97 (28MAR00) 3094-3099 et RE Johnson et al.; Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 97 (11APR00) 3838-3843, ainsi que dans EC Friedberg et al;; Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 97 (23MAY00) 5681-5683, une série d'articles et des commentaires sur les rôles des différentes ADN polymérases, insistant sur les polymérases IV et V récemment caractérisées.
La polymérase IV d'E.coli est capable de redresser la réplication de l'ADN au niveau d'une fourche de réplication décalée (misaligned), au prix d'un décalage (-1), mais elle n'est pas capable de rétablir la situation au niveau de nucléotides modifiés, car elle est dépourvue d'activité 3'> 5' exonucléasique. Ceci est réalisé par la polymérase V codée par umuC qui assure la synthèse dite translésions, assurant la transition entre réplication et réparation lors d'une pause au niveau d'une séquence altérée. Ces deux polymérases ont une faible spécificité sur des ADN normaux (avec un taux de mutation de 10-2 à 10-3), mais cela n'a guère d'importance , car ces polymérases n'ont pas accès à cet ADN et n'interviennent qu'en conjonction avec d'autres polymérases qui ouvrent la chromatine et les convoquent lors d'un incident.
Des homologues existent manifestement chez beaucoup d'autres organismes. La situation est malheureusement rendue très confuse par un terminologie confuse. Ainsi trouve-t-on une homologue de la polymérase IV chez l'homme qui est appelée, soit polk, soit polt chez l'homme, la polt est codée par le gène DIN B1, appelé aussi POLQ etc…, ce qui fait que j'ai bien du mal à m'y retrouver. Ce type de polymérase semble absent, cependant, chez Saccharomyces cerevisiae et l'analyse du génome, maintenant complètement séquencé, de Drosophila melanogaster ne montre aucune séquence homologue du gène dinB d'E.coli codant cette enzyme.
La polymérase V se retrouve également chez beaucoup d'autres organismes. Chez l'homme elle est codée par POLH et appelée pole. Avec son homologue très proche, Rad30 de la levure de bière, et contrairement aux ADN polymérases IV et V d'E.coli elle est capable de placer des adénines face à des dimères de thymine et contrairement à l'ADN polymérases V d'E.coli elle joue, peut être, un rôle de bourrage avec des adénines, quoiqu'il arrive.
source : www.inra.fr ou www.igmors.u-psud.fr
Pour plus d'informations, vous pouvez consulter
- Le monde végétal : du génome à la plante entière / Académie des sciences; dir. Roland Douce
- La génomique en biologie végétale / . J.-F. Morot-Gaudry, J.-F. Briat
- Le monde des végétaux : organisation, physiologie et génomique : cours et QCM / Yves Tourte,... Michel Bordonneau,... Max Henry,...Catherine Tourte,...
Vous pouvez également consulter Google scholar et cette bibliographie sur le site de l'INRA à qui vous pourrez éventuellement poser votre question.
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